De buitengevel van het gebouwencomplex staat aan de zijde van de Eerste Kamer en de Trêveszaal over de volle lengte in het water, inclusief het torentje van de minister-president. Volgens het Rijksvastgoedbedrijf zijn de gevels onder de waterlijn in slechte staat; het voeg- en metselwerk is er in de loop der jaren uitgespoeld. Er hebben zich al diverse lekkages voorgedaan waarbij het water uit de Hofvijver de kelders van het gebouw is binnengestroomd. Het grootste lek is inmiddels met behulp van duikers gedicht. Naast de gevels moet ook de bodem van de vijver op verschillende plekken worden verstevigd.
De aanwezige waterplanten, zoals de waterlelies, verhuizen tijdens de verbouwing naar een andere plek in de vijver. Erg diep is de Hofvijver overigens niet: rondom staat er hooguit 50 tot 100 centimeter water. In het midden is de vijver iets dieper.
Langs de buitenkant van het gebouw wordt momenteel een 180 meter lange strook bouwterrein aangelegd, nodig om de lekkende gevels en de gebrekkige fundering te herstellen. Hiervoor wordt zand gestort en een damwand geplaatst op 15 meter vanaf het gebouw. De Hofvijver wordt gedempt met 8.400 kuub zand. Daar bovenop komen industrieplaten te liggen. Zo ontstaat een werkplatform van waaraf men de gevels grondig kan aanpakken. De funderingen worden (door het zand heen) geïnjecteerd met grout, een cementsoort die veel gebruikt wordt voor grondstabilisatie en ook grondwaterstroming kan voorkomen.
Om de bouwplaats te kunnen inrichten heeft Van Schie heeft een rijbaan op het water aangelegd, bestaande uit 160 koppelbare pontons. Die zijn in de hoek van Het Buitenhof en de Lange Vijverberg te water gelaten en in secties naar de andere kant van de Hofvijver gevaren. Om te zorgen dat de zware vrachtwagens veilig de lager gelegen pontonbaan op en af kunnen rijden, heeft het bedrijf uit Mijdrecht een brugconstructie gemaakt, bestaande uit buispalen en zware stalen schotten. Die ligt in de hoek waar de vijver het minst diep is. Eeuwengeleden, toen hier nog geen kademuren stonden, lag op dezelfde plek zelfs een strandje. Het fungeerde destijds als drinkplaats voor de paarden van de gendarmerie en de cavalerie. Er schijnt ergens in de lege gebouwen nog een afbeelding te hangen waarop wachtende koetsen te zien zijn en paarden die staan te drinken uit de Hofvijver.